Rizikos variantai
VLOGMAS #18. Lemiamu momentu jis užmigo!
Remiantis ankstesnėmis ataskaitomis, kad glaudžiai reguliuojami CLU alternatyvūs transkriptai turi skirtingas funkcijas, išbandėme CLU vieno nukleotido polimorfizmą SNPįskaitant tuos, kurie susiję su AD kiekybiniu poveikiu rizikos variantai alternatyviems transkriptams. Šią hipotezę ištyrėme in vitro dvigubu luciferazės tyrimu, naudojant SK-N-SH ląsteles ir pelių pirminius rizikos variantai neuronus, ir nustatėme alelinį poveikį sustiprintojo funkcijai, atitinkančią mūsų post-mortem žmogaus smegenų rezultatus.
Šie rezultatai rodo biologinį mechanizmą, skirtą genetinei CLU asociacijai su AD rizika, ir rodo, kad rs yra vienas iš funkcinių DNR variantų, kurie yra šio asociacijos pagrindas. Įvadas Dviejose neseniai veikiančiose genomo tyrimų asociacijose rizikos variantai nustatyta, kad CLU yra Alzheimerio ligos AD rizikos genas. Clusterin, taip pat žinomas kaip apolipoproteinas J, yra glikoproteinas, pirmą kartą identifikuotas m. Jo daugiafunkcinės funkcijos apima vaidmenis apoptozėje, komplemento reguliavime, lipidų transportavime, spermos brandinimui, endokrininei sekrecijai, membranų apsaugai, ląstelių sąveikos skatinimui ir chaperonui.
Tai pasiekiama naudojant diskrečias transliacijos pradžios vietas, alternatyviai įvedant rizikos variantai tinklelį, nukreipiantį į rizikos variantai signalą prieš branduolinės lokalizacijos signalą. Klasterino branduolinė forma specifiškai rizikos variantai epitelio ląstelėse naviko augimo faktorius- 17, o prostatos ląstelėse nustatyta, kad skirtingos CLU izoformos turi skirtingą atsaką į androgenus ir priešingas funkcijas, susijusias su apoptoze.
- Kaip užsidirbti pinigų 500r
- Įmoka ar pamm sąskaita
- Rizikos veiksniai Anotacija Dažniausiai genocitų asociacijos tyrimai GWAS nustatė maždaug 40 lokų genetiškai paplitusių storosios žarnos vėžio CRC genetinių rizikos variantų.
Mes išbandėme savo hipotezę apie laikinų skilčių mėginių rinkinį be smegenų patologijos kontrolė ir sekėme kitame laikinų skilčių mėginiuose iš AD atvejų ir kontrolinių priemonių.
Rezultatai Trys skirtingos CLU susiliejimo formos su skirtingomis transkripcijos pradžios vietomis 1a pav.
Visuose RefSeq transkriptuose yra kodavimo seka tiek endoplazminiam retikului nukreiptam signalui, tiek branduolinės lokalizacijos rizikos variantai, tačiau ar jie visi naudoja pradinę transliacijos pradžios vietą ir apima abu signalus baltyme, nežinoma. Mūsų eksperimentuose, naudojant smegenų RNR, mes nepastebėjome transkripto, kuriame trūksta egzono 2, aprašyto krūties vėžio ląstelių linijoje, 13 tačiau radome transkriptą, apie kurį buvo rizikos variantai UCSC genomo naršyklėje GenBank acc CRneturint 1, 3 ir 4 egzonų, tokiu būdu trūksta tiek endoplazminio tinklelio nukreipimo signalo, tiek branduolio lokalizacijos signalo.
Rizikos veiksnys
Patvirtinome, kad iš kiekvieno transkripto buvo amplifikuoti vienas ir konkretūs amplikonai Sanger sekvenavimu, agarozės gelio elektroforeze ir DNR lydymosi kreivėmis. Pirmiausia ištyrėme protėvių informatyvius SNP žymenis kompiuterio analizėje ir nustatėme du išskirtinius asmenis PC-1, tikėtina, kad Afrikos protėviai, kurie buvo pašalinti iš tolesnės analizės.
Jokių papildomų kompiuterių nepastebėta išskirtinių. Naudojant log transformuotą rizikos variantai kiekį kaip rezultatą, taikėme bendrą linijinį modelį, apimantį amžių, lytį, PMI, PCR plokštelės ID tapatybę kad būtų atsižvelgta į plokštelės efektus, kai mes naudojome dvi šulinėlių realaus laiko plokšteles ir pirmą Informacinių SNP žymenų kompiuteris, kuriame atsispindi galimas liekamasis mišinys. Abiejose analizėse buvo įtrauktos plokštelės ID ir PMI, kad būtų atsižvelgta į galimus mažus efektus, nepriklausomai nuo jų reikšmės.
Tuomet kiekvieną SNP genotipą nuosekliai įtraukėme į modelio prognozę. Trijų transkriptų rezultatai SNP, kurie parodo bent jau nominalią reikšmingą poveikį transkripcijai, yra parodyti 2 lentelės kairėje pusėje.
Tada išnagrinėjome SNP genotipų poveikį kiekvienam transkriptui, koreguojant kitų dviejų transkriptų kiekį, kuris rizikos variantai pridėtas kaip prognozės modelyje. Ši analizė atspindi alternatyvios splazijos reguliavimą, pašalinant rizikos variantai transkriptų bendrą kintamumą ir pabrėžiant jų skirtumus. Visais atvejais tik rs išliko reikšmingas, o tai rodo, kad kiti SNP efektai splazavimui gali atspindėti jų susiejimo pusiausvyrą su rs Pilno rizikos variantai lentelė Pilno dydžio lentelė Norėdami išskirti artefaktus, atlikome kelis kokybės kontrolės veiksmus.
- Naujas dvejetainis parinktys
Toliau ištyrėme genotipų nustatymo klaidas ir patvirtino nukleotidų sekos nustatymą visiems rs genotipams. Toliau atkartojome savo rezultatą savarankiškame mėginių rinkinyje, kuris apėmė AD atvejus, leidžiančius išbandyti galimą su ligomis susijusį transkripcijos variantą.
- Mėnesio pasirinkimo strategija
- Tikrų pinigų uždirbimo kursai internete
- Elektroninės piniginės valiuta
Я понимаю это как знак согласия, - сказал он, и они не отрывались друг от друга всю ночь, согреваемые теплом камина.
Kiekybinis PGR plokštelės kintamasis nebebuvo taikomas, nes šiame eksperimente buvo naudojama viena plokštelė. Mes naudojome esamą protėvių informaciją apie Johno Hopkinso smegenų išteklių centro mėginius ir įtraukėme tik kaukazo žmones.
Naršymo meniu
Daugelis anksčiau pastebėtų amžiaus ir lyties poveikių įvairiems transkriptams buvo pakartoti šiame pavyzdyje, kaip parodyta 1 lentelėje. ChIP-seq ir DNazo padidėjusio jautrumo duomenis rodo, kad šis variantas gali būti tiesiogiai atsakingas už šio alternatyvaus transkripcijos pradžios reguliavimą.
Mes stebėjome žymiai didesnį rizikos alelio aktyvumą visiems konstruktams pirminiuose neuronuose rizikos variantai S- ir U-konstrukcijose SK-N-SH ląstelėse 2 pav. Firefly, palyginti su renilos luciferazės lygiais, rodoma su keturiais kartotiniais.
Visi konstruktai turi reikšmingus skirtumus tarp rizikos variantai rs alelių pirminėje neuronų kultūroje ir du iš trijų taip pat turi skirtumų SK-N-SH ląstelėse.
Rizikos veiksnys – Vikipedija
Kaip rizikos variantai, rizikos alelis rodo didesnį aktyvumą. RLU, santykiniai luciferazės vienetai. Pilno dydžio vaizdas Birūs bitkoinai parodyta 1 paveiksle, rs yra regione, kuriame yra reikšmingų reguliavimo potencialo įrodymų. Mes naudojome bioinformatikos programą rVista 2. Kol bus atlikti eksperimentiniai patikrinimai, šis įdomus rezultatas galėtų padėti išsiaiškinti šio SNP, šio transkripto ir AD santykį.
Atsižvelgiant į ankstesnius šio SNP genetinius susivienijimo rezultatus ir atskirus CLU transkriptų vaidmenis, 18 mes hipotetizuojame, kad alternatyvus splaissavimas yra kaip pakeisti pinigus bitkoinais ryšys tarp rs ir AD.
Tačiau yra neaiškios baltymų produktų funkcinės savybės ir tai, ar jų gamyba skiriasi per rizikos variantai transkriptus. Alternatyvi hipotezė yra ta, kad padidėjusi rizika nėra skirtingų transkripcijos funkcijų rezultatas, o jų specifinis rizikos variantai į skirtingus signalus, atsakymai, kurie gali būti klaidingai prarasti arba gauti rs rizikos alelio, kuris du panaikina, ir įveda vieną nauja transkripcijos faktoriaus surišimo vieta.
Nepriklausomai nuo to, kokia bus tikroji biologija, atsižvelgiant į mūsų rezultatus ir pranešimus apie genomo mastą, paaiškinant šių transkriptų savybes, atitinkami baltymai ir jų reguliavimas yra labai svarbūs AD tyrimams.
Kaip minėjome įžangoje, nors rs buvo atskirai pranešta dviejose populiacijose, tai dar viena CLU SNP, rs, kuri parodė bendrąsias nuosekliausias asociacijas. Kiti reti ar bendri rizikos variantai variantai gali būti pagrindas likusiai CLU priskiriamai rizikai ir literatūroje aprašytiems asociacijos modelių neatitikimams.
Tolesnis šių pasekmių paaiškinimas tebėra svarbus uždavinys, kurį palengvins šis ir būsimas darbas, išbandys naujas hipotezes ir perkelia vertimo tyrimus į priekį. Kartu su naujausiais AD pasiekimais nauju genų atradimu, mūsų supratimas apie ligos biologiją greitai pagerės, tikiuosi, kad tai bus naudinga pacientams ir rizikos grupėms.
Papildoma informacija.
